纳粹用尽各种手段处置受害者的尸体。在集中营里，尸体通常在火葬场或露天柴堆上焚化。这项工作由一群名为特遣队的囚犯来完成。
在犹太区，挖掘万人坑来掩埋那些死于饥饿和疾病的受害者的尸体。
在东欧的农村地区，在集体枪杀中丧生的犹太人通常被集体埋葬在他们居住的城镇附近的沟壑和森林中的万人坑中，很多时候这些万人坑是受害者自己挖的。许多万人坑仍然没有标记或未被发现。
