A nácik különféle módszereket alkalmaztak a holttestek eltüntetésére. A koncentrációs táborokban a holttesteket általában krematóriumokban vagy szabadtéri máglyákon égették el. Ezt a munkát a Sonderkommando elnevezésű fogolycsoportok végezték.
A gettókban tömegsírokat hoztak létre, hogy elhelyezzék az éhen és betegségben elhunytak maradványait.
Kelet-Európa vidéki területein a sortűzben meggyilkolt zsidókat gyakran együtt temették el tömegsírokban – amelyeket sokszor maguk az áldozatok ástak meg – a lakóhelyükhöz közeli szurdokokban és erdőkben. Ezek közül számos a mai napig jelöletlen vagy ismeretlen helyen található.