În 1945, dimensiunea populației evreiești din Bulgaria era aproape identică cu cea din 1939: constând din aproximativ 50.000 de persoane, sau 0,8% din populația totală a Bulgariei. Această consecvență a numărului de locuitori a fost obținută prin proteste și acțiuni efectuate de către o coaliție largă de lideri bisericești și parlamentari, precum și de oameni obișnuiți, când deportările au fost în cele din urmă ordonate în 1943. Cu toate acestea, costul salvării evreilor din „vechea” Bulgarie a fost deportarea a peste 11.000 de evrei de pe teritoriile Macedoniei și Traciei.
Bulgaria a rămas neutră până la aderarea la Axă în martie 1941, în schimbul controlului asupra Macedoniei și Traciei. Bulgaria adoptase deja legile antisemite ale Germaniei, inclusiv purtarea stelei galbene, prin Legea sa pentru protejarea națiunii, adoptată în ianuarie 1941. Cu toate acestea, scutirile sistematice pentru veterani, pentru cei convertiți la creștinism și cei aflați în căsătorii mixte au atenuat efectele legii. În iunie 1942, a fost creat un Comisariat pentru probleme evreiești sub comanda naționalistului antisemit Alexander Belev, organism menit să aplice legea existentă și să înființeze ghetouri.
În ianuarie 1943, Theodor Dannecker, un trimis al lui Adolf Eichmann, a sosit de la Berlin. Dannecker și Belev au convenit că 20.000 de evrei vor fi deportați din Bulgaria. În martie 1943, 11.343 de persoane au fost deportate la Auschwitz și Treblinka din Macedonia și Tracia, în timp ce arestările și ghetoizarea evreilor au avut loc în „Bulgaria veche” (granițele sale anterioare anului 1941). La acel moment, însă, situația politică și militară se întorsese decisiv împotriva Germaniei. Parlamentarii care au asistat la arestările din regiuni au protestat, semnând o scrisoare deschisă către regele Boris al III-lea al Bulgariei, cerându-i să oprească „măsurile excepționale și crude [...] care pot expune guvernul și întreaga națiune la acuzații de ucidere în masă”. Ștefan, mitropolitul ortodox al orașului Sofia, l-a avertizat pe regele Boris al III-lea că „Dumnezeu vă privește acțiunile din cer”. Decizia regelui Boris al III-lea - de a evacua evreii din Sofia în mediul rural - a fost contestată de cetățenii obișnuiți și considerată o nedreptate. Mulți evrei evacuați au fost ascunși și în mediul rural și, în august 1943, ambasadorul german la Sofia a scris către Berlin că deportările se vor relua doar dacă situația politică și militară se va îmbunătăți.